石榴樹根、莖、葉、花、果的發育均離不開水分，其各器官含水量分別為：果實80%～90%，籽粒66. 5%～83. 0%，嫩枝65.4%，硬枝53. 0%，葉片65. 9%～66. 8%。
水直接參與石榴樹體內各種物質的合成和轉化，也是維持細胞膨壓、溶解土壤礦質營養、平衡樹體溫度不可代替的重要因子。
水分不足和過多都會對石榴產生不良影響。水分不足，大氣濕度小，空氣干燥，會使光合作用降低，葉片因細胞失水而萎蔫。
據測定，當土壤含水量為12%～20%時有利于花芽形成和開花坐果及控制幼樹秋季旺長，促進枝條成熟；含水量為20. 9%～28%時有利于營養生長；含水量為23%～28%時有利于石榴樹安全越冬。
石榴樹屬于抗旱力強的樹種之一，但干旱仍是影響其正常生長發育的重要因素，在黃土丘陵區以及沙壤區生長的石榴樹明顯矮小，很易形成“小老樹”。
水分不足除了對樹體營養生長有影響外，對其生殖生長的花芽分化、顯蕾開花及坐果和果實膨大都有明顯的不利影響。
據測定，當30cm土壤含水量為5%時，石榴幼樹出現暫時萎蔫，含水量降至3%以下時，則出現永久萎蔫。反之，水分過多，日照不足，光合作用效率顯著降低，特別是花期遇雨或連陰雨天氣，樹體自身開花散粉受影響，而外界因素的昆蟲活動受阻，花粉被雨水淋濕，風力無法傳播，對坐果影響明顯。
在果實生長后期遇陰雨天氣時，由于光合產物積累少，果實膨大受阻，并影響著色。但當后期天氣晴好，光照充足，土壤含水量相對較低時，突然降水和灌水又極易造成裂果。
石榴樹對水澇反應也比較敏感，果園積水時間較長或土壤長期處于水飽和狀態，對石榴樹正常生長會造成嚴重影響。生長期連續4d積水，葉片發黃脫落，連續積水超過8d，植株死亡。
石榴樹在受水澇之后，由于土壤氧氣減少，根系的呼吸作用受到抑制，導致葉片變色枯萎、根系腐爛、樹枝干枯、樹皮變黑乃至全樹干枯死亡。
水分多少除直接影響石榴樹的生命活動外，還對土壤溫度、大氣溫度、土壤酸堿度、有害鹽類濃度、微生物活動狀況產生影響，對石榴樹發生間接作用。
